使用scipy.cluster快速实现聚类算法

聚类是一种常见的无监督学习方法,可以将数据分为具有相似特征的群集。我们通常使用sk-learn实现聚类,其实Scipy也封装了基础的聚类函数。

Scipy是Python科学计算库之一,提供了一组强大的算法和函数来实现聚类分析。本文将详细介绍如何使用Scipy来实现聚类。

原理介绍

聚类方法的基本思想是将数据点划分为互相间具有相似特征的群集,使得同一群集内的数据点相似度较高,不同群集间的相似度较低。

Scipy中提供了多种聚类算法,包括K均值、DBSCAN和层次聚类等。下面我们将以K均值算法为例进行介绍。

K均值算法是一种简单而有效的聚类方法,其基本步骤如下:

  • 1.随机初始化K个聚类中心点;

  • 2.将每个数据点分配给距离其最近的聚类中心; 

  • 3.更新每个聚类中心为其分配数据点的平均值; 

  • 重复步骤2和3,直到聚类中心不再变化或达到最大迭代次数。

案例

下面通过一个简单的例子来展示如何使用Scipy实现K均值聚类。

首先,导入所需的库和模块:

import numpy as np
from scipy.cluster.vq import kmeans, vq
from scipy.spatial.distance import cdist
import matplotlib.pyplot as plt

接下来,我们生成一些随机数据点:

# 生成数据点
np.random.seed(0)#随机种子,固定随机生成的数据点
n = 150
data = np.vstack((np.random.randn(n, 2) * 0.5 + [1, 1],
                  np.random.randn(n, 2) * 0.6 + [-1, 0],
                  np.random.randn(n, 2) * 0.4 + [0, 2]))

然后,我们使用K均值算法对数据进行聚类:

# 使用K均值算法对数据进行聚类
k = 3
centroids, _ = kmeans(data, k)
idx, _ = vq(data, centroids)

最后,我们将结果可视化展示出来:

# 可视化聚类结果
colors = ['b''g''r']
for i in range(k):
    cluster = data[idx == i]
    plt.scatter(cluster[:, 0], cluster[:, 1], c=colors[i])
plt.scatter(centroids[:, 0], centroids[:, 1], c='k', marker='x')
plt.show()

以上代码示例中,我们使用K均值算法对生成的数据进行聚类,其中K的值为3。通过将数据点分配给最近的聚类中心,并更新聚类中心以提高聚类效果,我们最终得到了三个聚类和聚类中心。

总结

本文介绍了使用Scipy实现聚类的方法。我们首先介绍了聚类的原理,然后使用K均值算法作为例子,展示了如何使用Scipy进行聚类。

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